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对于要求内毒素含量较少的应用（如哺乳动物细胞培养），应使用通过内部或外部超滤器产生超纯水（即I级水）的系统。超滤器的孔径很小，以截留分子量(MWCO)表示，单位是道尔顿。基于MWCO，内毒素、核酸酶、蛋白酶等物质会从产品水中去除。
